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納米磁珠技術(shù)逐漸成血漿蛋白組質(zhì)譜主流?

2024-12-1 21:34:08點擊:



       10月下旬,第23屆國際蛋白組學(xué)年會即HUPO2024,在德國東南部充滿巴洛克風(fēng)格建筑的歐洲小城的德累斯頓舉辦。

       HUPO2024是歷年來人數(shù)最多的一次,參與人數(shù)超過1800人,其中來自歐洲的參會者最多。

       歐洲是世界蛋白組學(xué)的一座高峰。質(zhì)譜一直是蛋白質(zhì)研究的黃金標(biāo)準(zhǔn)。質(zhì)譜儀通過讀取離子的質(zhì)荷比來識別分子。在電離蛋白質(zhì)分子,將其碎裂成更小的肽并測量其質(zhì)荷比后,將得到的質(zhì)譜與蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行匹配,以確定樣品中存在的蛋白質(zhì)的身份。

       質(zhì)譜蛋白組學(xué)大隊列正拉開帷幕。自從2020年開始,血漿蛋白組學(xué)前處理創(chuàng)新逐漸走向商業(yè)化(類如Seer Proteograph?),血漿蛋白檢測深度從幾百個蛋白提升到幾千種蛋白。隨著2023年賽默飛發(fā)布最新款高分辨質(zhì)譜儀Atral,血漿蛋白組學(xué)的通量也達(dá)到100SPD。開展血漿蛋白組大隊列的前提已經(jīng)成熟。當(dāng)今蛋白組學(xué)的扛大旗人——德國馬普所Matthias Mann教授。Mann組正在用Astral開展一個5萬人的血漿蛋白組大隊列。曾幾何時,在超多重血漿蛋白組學(xué),Seer占據(jù)非常有利的位置,一度有望成為類似于10X Genomics單細(xì)胞基因組這樣的爆款??上в捎谄洚a(chǎn)品定價過高、通用性差、營銷策略不當(dāng)?shù)鹊仍?,?dǎo)致其商業(yè)化進(jìn)程緩慢,市場遲遲無法打開。管理層對市場反饋也基本置之不理。

       這給其他公司留出了反應(yīng)的時間。在HUPO2024上紛紛亮相。

       瑞士老牌蛋白組學(xué)公司Biognosys和布魯克聯(lián)合推出了基于納米磁珠技術(shù)的P2富集(https://biognosys.com/resources/truediscovery-introducing-the-p2-plasma-enrichment-system/),這種新穎的 P2 血漿蛋白質(zhì)組學(xué)方法在先前發(fā)表的 5 種癌癥血漿樣品組中實現(xiàn)了 7,000 種蛋白質(zhì)的蛋白質(zhì)組覆蓋,在布魯克 timsTOF? HT 質(zhì)譜儀上表現(xiàn)出最高的重現(xiàn)性、前所未有的低豐度蛋白質(zhì)富集和無與倫比的通量。但只接受對外提供蛋白組數(shù)據(jù)檢測服務(wù),服務(wù)價格在500歐元一個樣本。放在歐洲,這已經(jīng)是比較便宜的價格了。

       丹麥的Evosep也推出了基于納米磁珠富集的血漿蛋白組學(xué)方案(https://www.evosep.com/applications/plasma/),聯(lián)合他們的Evosep液相設(shè)備,可以實現(xiàn)超過3000種的血漿低豐度蛋白組檢測。

       德國的PreOmics 蛋白組前處理公司,順勢推出了自己版本的納米磁珠富集產(chǎn)品(iST-Enrich https://www.preomics.com/products/enrich-ist),加入了這場戰(zhàn)役,可以實現(xiàn)超過2000種的血漿低豐度蛋白組檢測。
       在中國,也有納米磁珠專家進(jìn)入蛋白組學(xué)領(lǐng)域,其中廈門普睿邁格生物科技有限公司依托自己強(qiáng)大的磁珠表面修飾技術(shù),也推出了多種納米磁珠富集血漿血清的產(chǎn)品(http://www.5000js.com/Product/8096211554.html),可以實現(xiàn)近4000種的血漿低豐度蛋白組檢測。此外,來自芝加哥大學(xué)的 Nanomics 珞米生命科技、來自復(fù)旦大學(xué)的鄧春暉教授/百趣生物,也在該領(lǐng)域不斷開拓。


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