客戶采用鏈霉親和素磁珠捕獲DNA探索DNA主動(dòng)去甲基化新途徑——論文通訊
武漢大學(xué)和北京大學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室采用鏈霉親和素磁珠捕獲DNA探索DNA主動(dòng)去甲基化新途徑。
摘要：可以通過(guò)十一個(gè)11易位（TET）雙加氧酶介導(dǎo)的5mC氧化為5-羥甲基胞嘧啶（5hmC），5-甲?；奏ぃ?fC）和5-羧基胞嘧啶（5caC）來(lái)實(shí)現(xiàn)5-甲基胞嘧啶（5mC）的主動(dòng)去甲基化由胸腺嘧啶DNA糖基化酶（TDG）啟動(dòng)的堿基切除修復(fù)（BER）。 TDG-BER途徑可能導(dǎo)致DNA鏈斷裂的產(chǎn)生，從而可能損害基因組完整性。另外，TET產(chǎn)生的5caC的直接脫羧具有很高的吸引力，因?yàn)檫@種機(jī)制允許5mC轉(zhuǎn)化為胞嘧啶而不會(huì)形成DNA鏈斷裂。然而，人類(lèi)細(xì)胞中5caC中C–C鍵的裂解仍是一個(gè)懸而未決的問(wèn)題。我們使用攜帶5caC的發(fā)夾DNA底物在細(xì)胞提取物和活細(xì)胞中檢查了該反應(yīng)。與全細(xì)胞蛋白質(zhì)提取物一起溫育或轉(zhuǎn)染到人類(lèi)細(xì)胞中后，我們使用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS / MS）分析在單核苷酸和寡脫氧核苷酸水平上通過(guò)直接脫羧或BER監(jiān)測(cè)了5caC向胞嘧啶的轉(zhuǎn)化。我們的結(jié)果清楚地表明，人類(lèi)細(xì)胞中5caC可以直接轉(zhuǎn)化為胞嘧啶，為支持DNA主動(dòng)去甲基化的新途徑提供了證據(jù)。
https://www.chinesechemsoc.org/doi/full/10.31635/ccschem.020.202000286
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