蛋白A|Protein A 詳細(xì)介紹
在生物化學(xué)和分子生物學(xué)領(lǐng)域,Protein A作為一種重要的工具蛋白,在抗體純化、免疫沉淀等實(shí)驗(yàn)中發(fā)揮著不可或缺的作用。本文將深入探討Protein A的來(lái)源、結(jié)構(gòu)、功能、應(yīng)用及其與其他相關(guān)蛋白(如Protein G和Protein A/G)的區(qū)別,旨在為讀者提供一個(gè)全面而深入的理解。
關(guān)鍵點(diǎn)
- 蛋白A是從金黃色葡萄球菌中提取的一個(gè)重要抗體結(jié)合蛋白,已在抗體純化中應(yīng)用超過(guò)80年。
- 蛋白A具有較高的IgG結(jié)合親和力,主要通過(guò)與IgG的Fc區(qū)進(jìn)行非共價(jià)相互作用。
- 研究表明,工程化的蛋白A可以在更溫和的條件下進(jìn)行抗體純化,減少抗體的聚合。
- 由于穩(wěn)定性提升,工程化的蛋白A如Z域、C域等在不同pH環(huán)境下表現(xiàn)優(yōu)異,適合于高樣品負(fù)載的應(yīng)用。
- 各種非特異性結(jié)合和雜質(zhì)去除的方法已被提出,以提高抗體純化的選擇性和效率。
- 納米顆粒(如磁性納米顆粒)作為新的支持材料已被成功應(yīng)用于蛋白A的結(jié)合和抗體的純化。
- 蛋白A還有潛在的應(yīng)用于生物傳感器,用于低濃度抗體的快速檢測(cè)。
由于抗體對(duì)病毒性疾病、癌癥、風(fēng)濕病和其他神經(jīng)系統(tǒng)的治療作用,它們的產(chǎn)生和純化呈指數(shù)級(jí)增長(zhǎng)。2019 年,美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局 (FDA) 批準(zhǔn)了 PD-1 抗體和抗 EGFR mAb 等 90 種 mAb(單克隆抗體),而超過(guò) 50 種 mAb 仍處于臨床試驗(yàn)階段。此外,在治療中,它可以直接附著以激活固體支持物,并用作檢測(cè)抗原的敲擊劑 。
抗體中的哪些功能會(huì)導(dǎo)致這些特性?免疫球蛋白,即 Igs,分子量約為 150 kDa,兩條重鏈有 450-650 個(gè)氨基酸和兩條輕鏈有 214 個(gè)氨基酸,斯托克斯半徑為 4 nm,等電點(diǎn)在 4.0-8.6 范圍內(nèi)。它們由四條多肽鏈組成。兩條相同的 50 kDa γ重鏈和兩條相同的 25 kDa k 或 λ 輕鏈,可產(chǎn)生約 150 KDa 的蛋白質(zhì)(IgG1、IgG2、IgG4 為 146 KDa,IgG3 為 170 KDa)。兩條重鏈通過(guò)二硫鍵在鉸鏈中連接:IgG1 和 IgG4 的兩個(gè)鍵,IgG2 的 4 個(gè)鍵和 IgG3 的 11 個(gè)鍵。此外,輕鏈的最后一個(gè)半胱氨酸殘基和重鏈的第五個(gè)半胱氨酸殘基產(chǎn)生二硫鍵帶。基于由 82-96% 蛋白質(zhì)和 4-18% 碳水化合物組成的糖蛋白,人體中的五類(lèi) Ig 是 IgM、IgD、IgG、IgA 和 IgE。根據(jù) IgG 的結(jié)構(gòu)差異,將其分為四個(gè)亞類(lèi);IgG1、IgG2、IgG3 和 IgG4 在氨基酸水平上相同 90% 以上,而這些小于 10% 的差異(圖 1)對(duì)它們的功能和對(duì)各種類(lèi)型抗原的反應(yīng)起著重要作用。值得注意的是,幾乎所有已使用或未開(kāi)發(fā)的抗體都使用 IgG1 亞類(lèi)骨架。
圖 1.A) 四個(gè)亞類(lèi),B) IgG 及其片段的四肽鏈(重鏈;紅色和綠色,輕鏈;黃色)。
基于 Ig結(jié)構(gòu),Ig 分為兩條重鏈和兩條輕鏈。重鏈包括 N 末端可變結(jié)構(gòu)域 (VH) 和三個(gè)恒定結(jié)構(gòu)域 (CH1、CH2 和 CH3),而輕鏈由 N 末端結(jié)構(gòu)域 (VL) 和一個(gè)恒定結(jié)構(gòu)域 (CL) 組成。根據(jù)結(jié)合位點(diǎn),Ig 分為兩部分;兩個(gè)片段抗原結(jié)合位點(diǎn) (Fab) 區(qū)域和一個(gè)片段可結(jié)晶 (Fc) 區(qū)域(圖 1)。Fab 和 Fc 區(qū)通過(guò)二硫鍵連接在一起,稱(chēng)為柔性鉸鏈區(qū)。Fab 作為高選擇性位點(diǎn)與抗原結(jié)合,而 Fc 區(qū)與許多不同的蛋白質(zhì)結(jié)合,例如含有新生兒 Fc 受體的細(xì)胞表面受體和細(xì)菌蛋白,如蛋白 A 和蛋白 G 。
IgG3 具有 11 個(gè)二硫鍵,而其他 IgG 亞類(lèi)(IgG1、IgG2 和 IgG4)中只有 2-4 個(gè)二硫鍵。它導(dǎo)致 IgG3 有 13 種不同的多態(tài)性,稱(chēng)為同種異型,而 IgG1、IgG2 和 IgG4 分別為 4、1 和 0 種同種異型。這種差異僅導(dǎo)致 IgG3 與蛋白 G 或蛋白 A/G 相互作用,而不與蛋白 A 相互作用。
到目前為止,一些已發(fā)表的綜述研究了用于 Ig 親和純化的不同種類(lèi)的 Protein A,例如蛋白 A 模擬肽和工程蛋白,并比較了不同類(lèi)型的市售 Protein A 基質(zhì)及其性質(zhì) .納米抗體較小的替代抗體形式,例如抗原結(jié)合片段 (Fab) 或帶有末端六組氨酸標(biāo)簽的單鏈可變片段 (scFv),很容易通過(guò)固定化金屬親和色譜純化,但以前的研究表明 His 標(biāo)簽對(duì)納米抗體生物分布有負(fù)面影響。
一、Protein A的來(lái)源與結(jié)構(gòu)
Protein A是一種來(lái)源于金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的表面蛋白,其分子量約為42KDa。作為微生物來(lái)源的天然蛋白質(zhì),Protein A具有與哺乳動(dòng)物的免疫球蛋白(尤其是IgG)特異性結(jié)合的能力。這一特性使得Protein A在抗體純化、免疫沉淀等生物技術(shù)領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值。普睿邁格提供高質(zhì)量重組蛋白A(http://www.5000js.com/Product/6945134937.html)。

圖2. A) 蛋白A基因組成包含信號(hào)序列(S)、五個(gè)IgG結(jié)合域(D、E、A、B和C)、細(xì)胞壁附著區(qū)域(XM),B) IgG Fc區(qū)的三個(gè)β轉(zhuǎn)角(灰色片段,上部蛋白)與蛋白A的B域的兩個(gè)α螺旋(紅色片段,下部蛋白)之間的相互作用。IgG 結(jié)合結(jié)構(gòu)域:E、D、A、B 和 C(每個(gè)結(jié)構(gòu)域 58 個(gè)氨基酸殘基)沉降在反平行的三個(gè)α螺旋中,所有結(jié)構(gòu)域都顯示出與 IgG 的 Fc 區(qū)亞類(lèi)(IgG1、IgG2 和 IgG4)的單獨(dú)相互作用,具有親和常數(shù),KA 為 108 (?1),對(duì) IgG3 的親和力非常弱。
Protein A由以下功能域組成:- 5個(gè)同源的IgG結(jié)合域(E、D、A、B、C),每個(gè)結(jié)構(gòu)域均可結(jié)合IgG的Fc區(qū)域(Fahnestock et al., 1986)。
- 一個(gè)C端的細(xì)胞壁錨定結(jié)構(gòu)域。
- 研究表明,其對(duì)不同物種和IgG亞類(lèi)的結(jié)合效率存在差異,例如對(duì)人和兔IgG的結(jié)合能力較強(qiáng),而對(duì)鼠、山羊等IgG的結(jié)合較弱(Hober et al., 2007)。
- 重組Protein A的優(yōu)化
- 為克服天然Protein A與部分IgG亞類(lèi)結(jié)合的局限性并提高穩(wěn)定性,科研人員開(kāi)發(fā)了重組Protein A(如rProtein A),通過(guò)引入點(diǎn)突變?cè)鰪?qiáng)其耐堿性或改變親和力(Jansson et al., 1998)。這些改進(jìn)降低了配體脫落風(fēng)險(xiǎn),并延長(zhǎng)了層析介質(zhì)壽命。
結(jié)構(gòu)上,Protein A由多個(gè)IgG結(jié)合結(jié)構(gòu)域組成,這些結(jié)構(gòu)域能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合IgG的Fc區(qū)段,而與Fab區(qū)或輕鏈的結(jié)合則相對(duì)較弱。此外,天然的Protein A還含有一些未知功能的非Fc結(jié)合域,這些區(qū)域在Protein A與雜蛋白的結(jié)合中可能發(fā)揮一定作用,從而影響純化后IgG的純度。
蛋白質(zhì) | 尺寸 (kDa) | 目標(biāo) | 洗脫 pH |
---|---|---|---|
蛋白 A | 42 | FC、Fab | 3.5 |
蛋白 G | 30 | Fc、Fab、ScFv | 3.2 |
蛋白 L | 76–106 | Fab、ScFv、κ 輕鏈 | 2 |
蛋白質(zhì) Z | 6.7 | Fc | 3.6 |
蛋白質(zhì) LG | 50 | Fc、κ 輕鏈 | 2 |
蛋白 LA | 60 | Fc、κ 輕鏈 | 2 |
蛋白 AG | 47.3 | Fc | 3 |
CIP 是親和層析過(guò)程中的必要步驟,用于從純化設(shè)備中去除聚集的蛋白質(zhì)、核酸和脂質(zhì)等污染物。CIP 通常以一種簡(jiǎn)單易行的方式使用濃度為 0.1 M 的氫氧化鈉 (NaOH) 作為最有效的清潔劑>去除緊密結(jié)合的變性和聚集物種,并滅活大多數(shù)微生物,如細(xì)菌、病毒和內(nèi)毒素 。雖然這種方法很容易使用并以低成本實(shí)現(xiàn),但所有設(shè)備、蛋白質(zhì)和基質(zhì)都必須在高 pH 值下保持穩(wěn)定。為了提高蛋白 A 在堿 pH 值的穩(wěn)定性,蛋白質(zhì)工程取得了成功的結(jié)果,其中最著名的是對(duì)源自 B 結(jié)構(gòu)域的 Z 結(jié)構(gòu)域的研究 。
Nilsson 于 1987 年根據(jù)蛋白 A 的 B 結(jié)構(gòu)域的第二個(gè)結(jié)構(gòu)提出了 Z 結(jié)構(gòu)域的第一個(gè)概念。根據(jù)這些文章,直接參與 Fc 區(qū)和蛋白 A 相互作用的氨基酸位于每個(gè)結(jié)構(gòu)域的兩個(gè)螺旋上。盡管如此,研究證明,存在于結(jié)構(gòu)域 E、D 和 A 中的蛋氨酸殘基會(huì)增加蛋白 A 的敏感性。此外,在 28-29 位存在天冬酰胺-甘氨酸 (Asn-Gly) 對(duì)高 pH 值敏感,并且在 CIP 惡劣條件下脫氨基。該反應(yīng)是自發(fā)的、依賴(lài)于水的,并因氫氧根離子而加速。因此,缺乏 Asn-Gly 和降低水分含量是可取的。
1. 純化抗體
Protein A在抗體純化中的應(yīng)用是其最為突出的功能之一。通過(guò)將Protein A偶聯(lián)于支持物(如瓊脂糖、磁珠等)上,可以構(gòu)建一個(gè)高效的抗體純化系統(tǒng)。當(dāng)含有抗體的生物樣品(如血清、腹水、細(xì)胞培養(yǎng)液等)流經(jīng)這個(gè)系統(tǒng)時(shí),抗體中的Fc區(qū)段會(huì)與Protein A結(jié)合,從而實(shí)現(xiàn)抗體的分離和純化。瓊脂糖蛋白A磁珠請(qǐng)參考(http://www.5000js.com/Product/0293713052.html)
值得注意的是,由于Protein A與IgG的結(jié)合具有高度的特異性,因此這種方法能夠高效地去除樣品中的其他雜質(zhì),如血清白蛋白、細(xì)胞碎片等,從而得到高純度的抗體。此外,通過(guò)調(diào)整偶聯(lián)條件、洗脫條件等參數(shù),還可以進(jìn)一步優(yōu)化純化效果,滿(mǎn)足不同實(shí)驗(yàn)需求。
2. 免疫沉淀
除了純化抗體外,Protein A還常用于免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中。免疫沉淀是一種利用抗原-抗體特異性結(jié)合原理,從復(fù)雜蛋白混合物中分離出特定蛋白的方法。在實(shí)驗(yàn)中,首先將特異性抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合形成抗原-抗體復(fù)合物,然后利用Protein A與IgG的結(jié)合能力,將抗原-抗體復(fù)合物吸附到Protein A偶聯(lián)的支持物上。最后,通過(guò)洗脫等步驟,可以得到純化的目標(biāo)蛋白。
免疫沉淀技術(shù)不僅可以用于研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)之間的相互作用,還可以用于研究蛋白質(zhì)的翻譯后修飾、定位等生物學(xué)特性。此外,結(jié)合質(zhì)譜等高通量分析技術(shù),免疫沉淀還可以用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究,為揭示細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)提供有力工具。
3. 去除或減少非特異性背景
在免疫沉淀等實(shí)驗(yàn)中,非特異性背景的存在往往會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。為了降低非特異性背景,可以在實(shí)驗(yàn)中加入Protein A/G Beads等試劑。這些試劑能夠吸附樣品中的非特異性蛋白和雜質(zhì),從而降低背景干擾。同時(shí),由于Protein A/G具有更廣泛的抗體結(jié)合能力,因此還可以用于純化那些不能與Protein A單獨(dú)結(jié)合的抗體。
三、Protein A與其他相關(guān)蛋白的區(qū)別
在抗體純化與免疫沉淀領(lǐng)域,除了Protein A外,還有Protein G和Protein A/G等蛋白也常被用于這些實(shí)驗(yàn)中。為了更全面地理解Protein A的作用和優(yōu)勢(shì),我們需要將其與其他相關(guān)蛋白進(jìn)行比較和分析。
1. Protein G
除了蛋白 A,還有一些關(guān)于蛋白 G 的研究,它對(duì) IgG(所有亞型)和人血清白蛋白都有親和力。蛋白 G 的 C 端包含三個(gè)均相 IgG 結(jié)合結(jié)構(gòu)域,具有一個(gè)中央 α 螺旋和三個(gè)分子量為 11.5 kDa 的 β 折疊 。Protein G是一種來(lái)源于鏈球菌G族的細(xì)胞表面蛋白,也是III型Fc受體的一種。與Protein A類(lèi)似,Protein G也具有與IgG特異性結(jié)合的能力。然而,與Protein A不同的是,Protein G不僅能夠結(jié)合IgG的Fc區(qū)段,還能夠結(jié)合Fab區(qū)段。這使得Protein G能夠更廣泛地結(jié)合多種類(lèi)型的IgG分子,包括那些不能與Protein A結(jié)合的IgG。重組蛋白G購(gòu)買(mǎi)請(qǐng)參考(http://www.5000js.com/Product/6093125842.html)
此外,Protein G還具有較低的血清蛋白結(jié)合水平,因此純化得到的產(chǎn)物純度較高。同時(shí),由于Protein G的配基脫落率較低,因此在使用過(guò)程中能夠保持較高的穩(wěn)定性和可靠性。然而,需要注意的是,Protein G對(duì)某些特定種屬的抗體(如兔抗體)的親和力可能較低,因此在選擇使用時(shí)需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行權(quán)衡。
2. Protein A/G
當(dāng)然,由于它與白蛋白的非特異性相互作用,已經(jīng)對(duì)結(jié)構(gòu)修飾進(jìn)行了一些嘗試,例如僅使用 IgG 結(jié)合結(jié)構(gòu)域作為配體或它們與蛋白 A 結(jié)構(gòu)域的偶聯(lián)。Dong 及其同事成功地設(shè)計(jì)了蛋白 A 的 D 結(jié)構(gòu)域與蛋白 G 的 C1 結(jié)構(gòu)域的結(jié)合,其結(jié)合常數(shù)值分別比蛋白 G 和蛋白 A 高 12 倍和 8.4 倍。Protein A/G是一種兼具Protein A和Protein G特點(diǎn)的融合蛋白。它結(jié)合了Protein A和Protein G的結(jié)合位點(diǎn),因此具有更廣泛的抗體結(jié)合能力和更高的特異性。這使得Protein A/G在純化抗體和降低非特異性背景方面表現(xiàn)出更優(yōu)異的性能。
此外,由于Protein A/G具有更大的特異性表面區(qū)域和更多的表面抗體結(jié)合位點(diǎn),因此在使用過(guò)程中能夠減少非特異性結(jié)合的發(fā)生。這使得Protein A/G在免疫沉淀等實(shí)驗(yàn)中具有更高的靈敏度和準(zhǔn)確性。然而,需要注意的是,由于Protein A/G結(jié)合了兩種蛋白的特點(diǎn),因此其制備成本可能相對(duì)較高。
四、Protein A的應(yīng)用案例與注意事項(xiàng)
1. 應(yīng)用案例
在實(shí)際應(yīng)用中,Protein A已被廣泛應(yīng)用于各種抗體純化、免疫沉淀等實(shí)驗(yàn)中。例如,在制備單克隆抗體時(shí),可以利用Protein A偶聯(lián)的磁珠從細(xì)胞培養(yǎng)液中快速分離和純化抗體;在研究蛋白質(zhì)相互作用時(shí),可以利用Protein A進(jìn)行免疫共沉淀實(shí)驗(yàn),從而揭示蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò);在疾病診斷和治療中,可以利用Protein A純化的抗體進(jìn)行免疫組化、流式細(xì)胞術(shù)等檢測(cè)手段,為疾病的診斷和治療提供有力支持。
2. 注意事項(xiàng)
在使用Protein A進(jìn)行抗體純化或免疫沉淀實(shí)驗(yàn)時(shí),需要注意以下幾點(diǎn):
- 選擇合適的偶聯(lián)條件:不同的偶聯(lián)條件會(huì)影響Protein A與抗體的結(jié)合效率和穩(wěn)定性。因此,在選擇偶聯(lián)條件時(shí)需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行優(yōu)化。
- 控制洗脫條件:洗脫條件是影響純化效果的關(guān)鍵因素之一。通過(guò)調(diào)整洗脫液的pH值、離子強(qiáng)度等參數(shù),可以?xún)?yōu)化洗脫效果,提高抗體的純度和回收率。
- 避免非特異性結(jié)合:非特異性結(jié)合是影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性的重要因素之一。為了減少非特異性結(jié)合的發(fā)生,可以在實(shí)驗(yàn)中加入適量的抑制劑或進(jìn)行預(yù)清除處理。
- 注意實(shí)驗(yàn)安全:由于Protein A來(lái)源于金黃色葡萄球菌等微生物,因此在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需要注意無(wú)菌操作和安全防護(hù),避免實(shí)驗(yàn)污染和交叉感染的發(fā)生。
Protein A作為一種重要的工具蛋白,在抗體純化、免疫沉淀等生物技術(shù)領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值。通過(guò)深入了解Protein A的來(lái)源、結(jié)構(gòu)、功能及其與其他相關(guān)蛋白的區(qū)別,我們可以更好地利用這一工具蛋白進(jìn)行科學(xué)研究和技術(shù)開(kāi)發(fā)。
未來(lái),隨著生物技術(shù)的不斷發(fā)展和創(chuàng)新,Protein A的應(yīng)用領(lǐng)域?qū)?huì)更加廣泛和深入。例如,在抗體藥物研發(fā)中,可以利用Protein A進(jìn)行高效、快速的抗體篩選和純化;在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中,可以利用Protein A進(jìn)行高通量的蛋白質(zhì)分離和鑒定;在疾病診斷和治療中,可以利用Protein A純化的抗體進(jìn)行更加精準(zhǔn)和有效的檢測(cè)和治療手段。
總之,Protein A作為一種重要的生物技術(shù)工具,將在未來(lái)的科學(xué)研究和技術(shù)創(chuàng)新中發(fā)揮更加重要的作用。我們相信,在不久的將來(lái),Protein A將會(huì)為生物科學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展帶來(lái)更多的驚喜和突破。
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