臨床糖蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法綜述
3.3 癌癥
癌癥是全球健康的一大挑戰(zhàn),每年大約有1000萬新病例和超過600萬死亡病例。在各種癌癥類型中,肺癌、結(jié)直腸癌、胃癌和乳腺癌尤為常見。206-208癌癥的成因多種多樣。生物科學(xué)的進(jìn)步提高了我們對(duì)癌癥的理解,突出了基因突變、感染和環(huán)境因素作為其發(fā)展的主要貢獻(xiàn)因素。
為了揭開癌癥的奧秘,研究人員已經(jīng)確定了幾個(gè)腫瘤衍生的生物標(biāo)志物,包括基因、蛋白質(zhì)及其修飾形式,如糖蛋白,以及代謝途徑。這些發(fā)現(xiàn)在提高癌癥的診斷和治療方面至關(guān)重要。傳統(tǒng)的癌癥治療包括手術(shù)、放療和化療。這些方法各自具有獨(dú)特的臨床益處和局限性,通常伴隨著各種并發(fā)癥。在過去幾十年中,免疫療法作為一種開創(chuàng)性和創(chuàng)新的治療方式出現(xiàn),其發(fā)展迅速,并在對(duì)抗腫瘤方面顯示出顯著的療效。這種方法徹底改變了我們對(duì)癌癥治療的方法,強(qiáng)調(diào)了靶向分子療法的重要性。這些療法旨在破壞腫瘤細(xì)胞的代謝過程,導(dǎo)致其死亡,同時(shí)保留健康細(xì)胞。通過識(shí)別特定的分子靶標(biāo),這一精確性得以實(shí)現(xiàn),而這一過程得益于組學(xué)技術(shù)的進(jìn)步——包括基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)。這些技術(shù)使我們能夠詳細(xì)分析異常反應(yīng)、酶和細(xì)胞代謝產(chǎn)物,顯著促進(jìn)了我們對(duì)腫瘤生物學(xué)的理解以及有效抗癌藥物的開發(fā)。
此外,隨著研究深入探討蛋白質(zhì)與癌癥之間的關(guān)系,糖蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域已成為焦點(diǎn)。糖蛋白,作為功能性蛋白質(zhì),已被確定為癌癥起始和進(jìn)展中的關(guān)鍵參與者。從研究這些糖蛋白中獲得的見解不僅豐富了我們對(duì)疾病理解,還開辟了新的治療干預(yù)途徑。
圖5顯示了可作為不同癌癥潛在診斷生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)的糖蛋白,如肺癌、結(jié)直腸癌(CRC)、胃癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌、卵巢癌和肝癌。在以下部分中,我們將探討糖蛋白質(zhì)組學(xué)研究對(duì)我們理解癌癥及其在開發(fā)新治療策略中的應(yīng)用的重要貢獻(xiàn)。這一探索將強(qiáng)調(diào)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)在腫瘤學(xué)中的變革性影響,為全球患者提供更有效、侵入性更小的治療選擇帶來希望。
3.3.1 肺癌
肺癌被普遍認(rèn)為是全球健康的重要問題,其發(fā)病率和死亡率顯著。它引起了廣泛關(guān)注和研究努力。從病理學(xué)角度來看,肺癌可分為兩種主要類型:小細(xì)胞肺癌(SCLC)和非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)。目前對(duì)NSCLC的治療策略受到了越來越多的關(guān)注,因?yàn)镾CLC機(jī)制的難以捉摸阻礙了藥物開發(fā)工作。此外,值得注意的是,NSCLC有可能轉(zhuǎn)變?yōu)镾CLC,特別是在表現(xiàn)出表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)突變的患者中。237在遺傳突變和異常蛋白質(zhì)識(shí)別方面的開創(chuàng)性研究為分子靶向療法的發(fā)展鋪平了道路。這些療法已顯示出抑制腫瘤細(xì)胞增殖的療效,標(biāo)志著治療肺癌的重大進(jìn)展。
在臨床糖蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域,已經(jīng)鑒定出各種生物標(biāo)志物或正在進(jìn)行研究。人類唾液已被證明是臨床診斷的寶貴資源。劉等人進(jìn)行的研究涉及分析健康個(gè)體和NSCLC患者的唾液樣本。這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)NSCLC組中有154個(gè)N-糖位點(diǎn)和259個(gè)位點(diǎn)特異性糖型被調(diào)節(jié)。值得注意的是,一些N-糖位點(diǎn)位于相同的糖蛋白中,并且這些位點(diǎn)上附著的糖鏈表現(xiàn)出不同程度的表達(dá)。這尤其在糖蛋白如血紅蛋白(Hp)、粘蛋白-5B、乳鐵蛋白和α-1-酸性糖蛋白1中尤為明顯,所有這些都與NSCLC密切相關(guān)。在SCLC中,巖藻糖基化過程特別普遍。Ahn等人鑒定了四種主要類型的巖藻糖基化蛋白質(zhì):血清淀粉樣蛋白P成分、補(bǔ)體成分9(C9)、Kallistatin和對(duì)氧肟酶/羧酸酯酶1。這些糖蛋白顯示出SCLC的重要診斷潛力。此外,由腫瘤細(xì)胞分泌的小細(xì)胞外囊泡(sEVs)攜帶大量有用信息,適用于不同亞型癌癥的診斷。特定研究強(qiáng)調(diào)了來自SCLC和NSCLC細(xì)胞的sEVs上的N-糖基化模式,突出了糖蛋白在癌癥診斷中的復(fù)雜性和潛力。243通過仔細(xì)比較標(biāo)記蛋白的含量,研究發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞來源的sEVs表現(xiàn)出不同的類型,每種都以不同水平的標(biāo)記蛋白為特征。這一發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了sEVs之間的定性差異,特別強(qiáng)調(diào)了差異表達(dá)的63型簇分化(CD63)糖蛋白,它具有三個(gè)潛在的糖位點(diǎn)。具體來說,分析了不同sEVs中存在的核糖鏈的核心N-糖鏈結(jié)構(gòu)。在來自三種NSCLC細(xì)胞的sEVs中,觀察到雙天線和三天線N-糖鏈的優(yōu)勢(shì),以及核心巖藻糖基化的重要存在。這一發(fā)現(xiàn)與來自SCLC的sEVs形成鮮明對(duì)比,后者顯示出N-糖鏈結(jié)構(gòu)的巨大異質(zhì)性,反映了SCLC細(xì)胞類型的多樣性。此外,研究利用凝集素輔助探索了NSCLC sEV和SCLC sEV中的N-糖基化。一個(gè)顯著的發(fā)現(xiàn)是兩種sEV類型都表達(dá)了整合素αV。然而,一種特定的上皮特異性整合素,α6β4異二聚體,在NSCLC sEV中被獨(dú)特地鑒定出來,其中它被NSCLC細(xì)胞中的N-糖鏈修飾。這種特異性為靶向癌癥sEV中的N-糖蛋白開辟了道路,為檢測(cè)和潛在的創(chuàng)新治療策略提供了新的途徑。
在醫(yī)學(xué)研究中,不僅識(shí)別用于診斷的生物標(biāo)志物至關(guān)重要,而且揭示藥物抗性背后的復(fù)雜性也在制定有效的治療策略和評(píng)估患者結(jié)果中發(fā)揮關(guān)鍵作用。與藥物抗性相關(guān)的一個(gè)關(guān)鍵因素是蛋白質(zhì)糖基化的異常改變。先前的研究揭示了NSCLC中膜蛋白的N-糖基化增加對(duì)順鉑的抗性,順鉑是一種常用的化療藥物。這項(xiàng)研究鑒定了297個(gè)膜糖蛋白,它們?cè)贏549細(xì)胞和其順鉑耐藥對(duì)應(yīng)物A549/DDP之間的表達(dá)存在差異,其中157個(gè)糖蛋白上調(diào),主要與細(xì)胞粘附和藥物反應(yīng)相關(guān),而140個(gè)下調(diào),大多與細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和遷移相關(guān)。此外,基于凝集素納米探針的親和質(zhì)譜法被應(yīng)用于探索與肺癌相關(guān)的異常糖蛋白。該方法被用來仔細(xì)檢查從人肺腺癌細(xì)胞系PC9中用MNPs富集并與橙黃藻凝集素結(jié)合的糖蛋白。通過LC-MS/MS分析,一個(gè)值得注意的發(fā)現(xiàn)被揭示。與對(duì)吉非替尼敏感的PC9細(xì)胞系相比,PC9酪氨酸激酶抑制劑耐藥變體(PC9-IR)表現(xiàn)出顯著更高的巖藻糖基化水平。這在EGFR的糖位點(diǎn)N413的末端巖藻糖基化中尤為明顯。這些修飾阻礙了表皮生長(zhǎng)因子與其受體之間的正常相互作用,從而影響了受體形成二聚體的能力。這反過來影響細(xì)胞生長(zhǎng)和對(duì)某些藥物的反應(yīng),包括吉非替尼。
在肺癌的發(fā)展過程中,經(jīng)常觀察到異常的糖基化模式,表明開發(fā)有效的糖基化抑制劑可能有益。作為一種潛在的抑制劑,pictilisib利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和體外篩選技術(shù)被測(cè)試,以評(píng)估Pictilisib處理的A549細(xì)胞中各種N-糖鏈的豐度,包括高甘露糖、未修飾、巖藻糖基化、唾液酸化和唾液巖藻糖基化糖鏈。這些結(jié)果表明,pictilisib處理顯著降低了巖藻糖基化和唾液酸化N-糖鏈的整體相對(duì)豐度。值得注意的是,其中一些糖鏈涉及細(xì)胞凋亡、粘附和DNA損傷修復(fù)等過程。當(dāng)用pictilisib處理時(shí),諸如丙氨酸氨基肽酶、一種解整合素和金屬蛋白酶10、整合素β-1和整合素α3等糖蛋白,在特定糖位點(diǎn)上的巖藻糖基化、唾液酸化和唾液巖藻糖基化水平降低。這些糖蛋白在與細(xì)胞粘附、凋亡、DNA損傷反應(yīng)和細(xì)胞對(duì)化學(xué)刺激的反應(yīng)相關(guān)的途徑中富集。
總之,關(guān)于肺癌機(jī)制、診斷和治療糖基化水平以及糖蛋白質(zhì)組學(xué)進(jìn)展的最新發(fā)現(xiàn)既令人驚訝又令人鼓舞。然而,諸如不充分的樣本量和不一致的檢查標(biāo)準(zhǔn)等各種因素阻礙了糖蛋白檢測(cè)作為廣泛認(rèn)可的肺癌診斷實(shí)驗(yàn)室方法的接受。此外,準(zhǔn)確識(shí)別肺癌亞型對(duì)于選擇適當(dāng)?shù)闹委熀皖A(yù)測(cè)患者預(yù)后至關(guān)重要,糖蛋白質(zhì)組學(xué)可以在這一過程中發(fā)揮重要作用。理想情況下,糖蛋白的不同組分將允許對(duì)亞型進(jìn)行精確驗(yàn)證,但當(dāng)前數(shù)據(jù)仍不足以可靠診斷。必須承認(rèn),在揭示糖基化復(fù)雜性方面仍有許多工作要做,包括與肺癌相關(guān)的確切糖基化和生物學(xué)功能。這一領(lǐng)域的進(jìn)展有潛力為肺癌患者帶來顯著益處。
3.3.2 結(jié)直腸癌
CRC是全球主要的健康挑戰(zhàn)之一,影響結(jié)腸和/或直腸。它在全世界最常見的癌癥中排名靠前,導(dǎo)致顯著的發(fā)病率和死亡率。從歷史上看,CRC主要影響中年和老年人群,特別是50歲及以上的個(gè)體。然而,最近的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示了一個(gè)令人擔(dān)憂的趨勢(shì):年輕人群中心CRC的發(fā)病率增加。作為回應(yīng),醫(yī)學(xué)界已將其武器庫(kù)擴(kuò)展到傳統(tǒng)的手術(shù)、化療和放療之外。引入了免疫療法和分子靶向療法的創(chuàng)新,旨在改善治療結(jié)果。這些先進(jìn)的策略專注于修改腫瘤微環(huán)境(TME)或直接抑制癌細(xì)胞的增殖,從而提供更有效和高效的方法來對(duì)抗CRC。通過應(yīng)用先進(jìn)的定量糖蛋白質(zhì)組技術(shù),在CRC組織中鑒定了大量的N-糖蛋白。這包括發(fā)現(xiàn)九種顯著上調(diào)的糖蛋白,與細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞粘附和細(xì)胞遷移等關(guān)鍵生物過程相關(guān)。在另一項(xiàng)研究中,又鑒定了160種表達(dá)上調(diào)的糖蛋白。其中,值得注意的例子包括細(xì)胞間粘附分子1(ICAM1)和脂肪細(xì)胞質(zhì)膜相關(guān)蛋白(APMAP)。ICAM1在各種細(xì)胞功能中發(fā)揮關(guān)鍵作用,包括增殖、分化、死亡、凋亡和血管生成。此外,APMAP的存在與肝轉(zhuǎn)移相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了CRC中涉及的復(fù)雜分子機(jī)制,并突出了治療干預(yù)和研究的潛在糖基化靶點(diǎn)。
3.3.3 肝癌
肝癌的死亡率在所有癌癥中位居前列,主要原因是大多數(shù)患者在被診斷時(shí)已處于晚期,這通常會(huì)導(dǎo)致不理想的預(yù)后。大多數(shù)肝癌被歸類為肝細(xì)胞癌(HCC)。這些癌的治療通常涉及化療和/或免疫療法。近期的流行病學(xué)研究已經(jīng)確定肥胖、肝炎、酒精消費(fèi)、吸煙和糖尿病是LC的主要風(fēng)險(xiǎn)因素。這些因素促成了肝臟中炎癥因子的激活和免疫系統(tǒng)的反應(yīng),包括異常糖基化蛋白的產(chǎn)生。
在中國(guó),乙型肝炎病毒(HBV)感染是HCC的主要風(fēng)險(xiǎn)因素之一。對(duì)HCC組織和周圍組織的詳細(xì)分析表明,與鄰近非腫瘤組織相比,腫瘤組織中巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶的調(diào)節(jié)異常,這與糖蛋白如IgA1和IgG中巖藻糖基化N-糖鏈的增加有關(guān)。
此外,對(duì)于與HBV相關(guān)的HCC中的Hp也報(bào)告了類似的發(fā)現(xiàn),這突顯了不同研究中一致的模式。在這項(xiàng)研究的基礎(chǔ)上,Li等人通過檢查HCC患者的尿液樣本中的EVs取得了顯著進(jìn)展。他們的工作鑒定了344種在HCC患者中表達(dá)不同的獨(dú)特N-糖肽,其中36種被下調(diào),而驚人的308種上調(diào)。
其中,天冬酰胺連接的糖基化蛋白1同源物參與了N-糖基化的主要步驟。此外,研究還探討了上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)誘導(dǎo)因子,如TGF-β,對(duì)肝細(xì)胞纖維化和癌變的影響,揭示了這些過程的增加。用肝細(xì)胞生長(zhǎng)因子處理導(dǎo)致兩種類型的HCC細(xì)胞,SMMC-7721和HepG2,出現(xiàn)類似EMT的變化。在這些細(xì)胞中,幾乎在葉酸受體α(FOLR1)的N69糖位點(diǎn)上鑒定了80種糖鏈,這突出了糖基化過程與癌癥進(jìn)展之間復(fù)雜的關(guān)系。進(jìn)一步分析顯示,在EMT過程中FOLR1的核心巖藻糖基化增加。對(duì)唯一的核心巖藻糖基化酶,巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶(FUT8)的評(píng)估表明,F(xiàn)UT8的含量與FOLR1的核心巖藻糖基化水平和葉酸攝取能力呈正相關(guān),這可能為HCC的診斷和治療提供新的生物標(biāo)志物。
在HCC研究領(lǐng)域,不僅研究生物標(biāo)志物至關(guān)重要,而且探索與HCC轉(zhuǎn)移相關(guān)的糖生物標(biāo)志物也非常重要。一項(xiàng)利用先進(jìn)的定量分析技術(shù)檢查非肝外轉(zhuǎn)移與非轉(zhuǎn)移樣本中N-糖蛋白的研究揭示了11種糖蛋白在N-糖位點(diǎn)占據(jù)上的顯著變化。這些糖蛋白,包括銅藍(lán)蛋白(CP)、纖維連接蛋白-1和結(jié)合蛋白,發(fā)揮細(xì)胞粘附和遷移的關(guān)鍵作用。它們被鑒定為癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的潛在生物標(biāo)志物和預(yù)后不良的指標(biāo)。282-284此外,p38 MAPK和NF-κB途徑在腫瘤組織中持續(xù)存在。此外,溶質(zhì)載體家族35成員A2(SLC35A2),它促進(jìn)UDP半乳糖(Gal)從細(xì)胞質(zhì)到高爾基體或ER的運(yùn)輸,并參與糖基化,在HCC組織中的增加與癌細(xì)胞的侵襲、粘附、轉(zhuǎn)移和改變膜糖鏈輪廓的能力有關(guān),這突顯了糖生物標(biāo)志物在HCC進(jìn)展中的復(fù)雜相互作用。
總之,診斷和分類肝癌的主要方法主要依賴于AFP的測(cè)量和來自肝臟的一系列功能性酶。然而,這些生物標(biāo)志物在診斷中的準(zhǔn)確性仍然是一個(gè)令人關(guān)注的問題。因此,迫切需要識(shí)別新的生物標(biāo)志物,以幫助臨床診斷。此外,深入理解肝癌背后的機(jī)制將顯著增強(qiáng)治療策略,特別是在涉及各種糖蛋白的分子水平上。目前,治療通常優(yōu)先使用索拉非尼和/或mAbs,如nivolumab和pembrolizumab,作為一線藥物。然而,這些治療的有效性有些有限,一些患者對(duì)這些藥物表現(xiàn)出明顯的抗藥性。因此,必須研究潛在靶標(biāo)并開發(fā)能夠有效抑制HCC增殖的創(chuàng)新藥物。
3.3.4 胰腺癌
胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)是全球最常見的胰腺癌之一,以快速進(jìn)展和高死亡率為特征。在機(jī)制上,代謝重編程是PDAC的關(guān)鍵特征,伴隨著復(fù)雜和異質(zhì)性的腫瘤微環(huán)境(TME),為藥物抗性奠定了基礎(chǔ)。PDAC的風(fēng)險(xiǎn)因素包括家族史、感染、糖尿病、吸煙和肥胖。PDAC的診斷通常涉及臨床評(píng)估、活檢、影像學(xué)研究和腫瘤生物標(biāo)志物的評(píng)估,包括糖抗原19-9(CA19-9)、糖抗原242(CA242)、糖抗原125(CA125)、癌胚抗原(CEA)和K-RAS基因突變。295 PDAC治療的主要方法結(jié)合了系統(tǒng)化療的手術(shù)。296,297 然而,對(duì)更準(zhǔn)確和有效的診斷和治療策略的追求導(dǎo)致了免疫療法和分子靶向治療的探索,以及各種糖蛋白的識(shí)別。CA19-9是一個(gè)有用的生物標(biāo)志物,通常在大多數(shù)胰腺癌患者的血清中升高。這個(gè)生物標(biāo)志物通過多種機(jī)制,如糖基化、與E選擇素的相互作用、增強(qiáng)血管生成和參與免疫反應(yīng),發(fā)揮著加速胰腺癌進(jìn)展的關(guān)鍵作用。CA19-9(唾液酸-Lewis a)的形成涉及逐步添加糖基團(tuán)到前體的α1,4連接的巖藻糖上。這一特定過程由單一酶,巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶3(FUT3)促進(jìn),該酶負(fù)責(zé)通過α1,4連接添加基團(tuán),從而導(dǎo)致CA199的形成。然而,這種酶在小鼠中顯著缺失,這為在這些模型中的研究帶來了挑戰(zhàn)。為了解決這一差距,進(jìn)行了一項(xiàng)實(shí)驗(yàn),以在小鼠中誘導(dǎo)人類FUT3和β1,3-半乳糖基轉(zhuǎn)移酶5(β3GALT5)的表達(dá),旨在在它們的系統(tǒng)中人工合成CA19-9。誘導(dǎo)后,表現(xiàn)出升高的CA19-9水平的小鼠最初經(jīng)歷了急性和慢性胰腺炎,這標(biāo)志著炎癥因子的增加。此外,觀察到CA19-9水平的增加與胰腺癌進(jìn)展機(jī)制的過度激活之間存在正相關(guān)。誠(chéng)然,當(dāng)依賴CA19-9水平時(shí),診斷過程有時(shí)會(huì)受到假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果的阻礙。為了提高診斷精度,識(shí)別來自患者樣本的額外生物標(biāo)志物變得至關(guān)重要。一項(xiàng)利用MALDI-MS技術(shù)的研究調(diào)查了胰腺癌患者和具有陰性CA19-9結(jié)果的良性胰腺疾病患者的IgG血清半乳糖基化譜。發(fā)現(xiàn)胰腺癌組的IgG半乳糖基化水平顯著高于對(duì)照組。此外,當(dāng)與CA19-9水平一起評(píng)估時(shí),診斷的準(zhǔn)確性顯著提高。這種方法強(qiáng)調(diào)了結(jié)合多個(gè)生物標(biāo)志物以完善胰腺疾病診斷過程的潛力。分析和比較非轉(zhuǎn)移性和轉(zhuǎn)移性樣本中的糖蛋白質(zhì)組輪廓對(duì)于選擇適當(dāng)?shù)闹委熀皖A(yù)測(cè)患者預(yù)后至關(guān)重要。吳等人使用定量糖蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)告稱,胰腺癌患者的血漿樣本中有22個(gè)糖肽上調(diào),其中巖藻糖基化SERPINA1表現(xiàn)突出。他們的研究發(fā)現(xiàn)巖藻糖基化SERPINA1水平與胰腺癌的階段和患者預(yù)后之間存在顯著關(guān)系。具體來說,巖藻糖基化SERPINA1的高水平與增加的腫瘤結(jié)節(jié)轉(zhuǎn)移階段相關(guān),并與較差的預(yù)后和總體生存率相關(guān)。這一發(fā)現(xiàn)突出了巖藻糖基化SERPINA1作為診斷胰腺癌的新生物標(biāo)志物的潛力。整合蛋白質(zhì)組學(xué)和N-糖蛋白質(zhì)組學(xué)已成為評(píng)估胰腺癌藥物療效的有價(jià)值工具。
在一項(xiàng)研究中,兩種胰腺癌細(xì)胞系PANC-1和BxPC-3用吉西他濱、阿司匹林或兩者的組合處理。值得注意的是,阿司匹林的添加抑制了這些細(xì)胞系的活性。為了闡明這種效應(yīng)的潛在機(jī)制,進(jìn)行了完整的N-糖肽定量。這一分析揭示了阿司匹林和N-糖基化之間的顯著協(xié)同作用。假設(shè)阿司匹林影響LAMP1/2的唾液酸化和高甘露糖修飾,從而抑制細(xì)胞自噬并增強(qiáng)吉西他濱的療效??傊?,N-糖蛋白質(zhì)組學(xué)為理解與胰腺癌相關(guān)的治療靶標(biāo)和藥物抗性機(jī)制提供了新的視角。
總之,糖蛋白質(zhì)組技術(shù)的進(jìn)步導(dǎo)致了眾多糖蛋白靶標(biāo)的識(shí)別,這對(duì)于闡明胰腺癌的機(jī)制和開發(fā)有效治療至關(guān)重要。已經(jīng)建立了異常糖基化與胰腺癌之間的顯著相關(guān)性,某些生物標(biāo)志物被識(shí)別為疾病進(jìn)展的指標(biāo)。然而,胰腺癌的異質(zhì)性使得探索其糖蛋白質(zhì)組景觀變得復(fù)雜。此外,在MS過程中糖蛋白結(jié)構(gòu)的丟失和降解進(jìn)一步增加了結(jié)果的不確定性。因此,必須進(jìn)行更深入的研究以理解與這種癌癥相關(guān)的因果關(guān)系和功能,這些努力無疑將為臨床治療帶來顯著益處。糖蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域產(chǎn)生了重要發(fā)現(xiàn),為深入理解癌癥生物學(xué)提供了見解。例如,當(dāng)前的研究集中在評(píng)估腫瘤細(xì)胞中的糖基化水平,識(shí)別蛋白質(zhì)的異常糖基化,并了解相關(guān)酶的激活。目前,只有少數(shù)幾個(gè)臨床診斷生物標(biāo)志物,包括AFP、PSA、ECA和CA19-9,獲得了美國(guó)FDA的批準(zhǔn)。許多糖蛋白標(biāo)記物仍在研究中。然而,大多數(shù)現(xiàn)有標(biāo)記物的準(zhǔn)確性需要在未來的研究中進(jìn)一步驗(yàn)證。因此,確切的診斷仍然依賴于活檢和病理分析,這些是復(fù)雜且不易大規(guī)模實(shí)施的。因此,收集血清、尿液和唾液等樣本進(jìn)行糖鏈分析是一種更方便的方法。隨著先進(jìn)算法的整合,預(yù)計(jì)糖蛋白質(zhì)組診斷方法的廣泛應(yīng)用將在未來成為現(xiàn)實(shí)。
圖5:糖蛋白組學(xué)技術(shù)建立的癌癥相關(guān)生物標(biāo)志物
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